В литературе встречаются разные подходы к решению вопроса о том, в каком году епархия сменила название с «Енисейская и Красноярская» на «Красноярская» (или «Красноярская и Енисейская»): 1925, 1934, 1942 или другом. По всей видимости, с титулом «Красноярский» был хиротонисан 8.3.1925 священномученик Амфилохий (Скворцов). В 1925 кафедральный город (Красноярск) перестал был центром Енисейской губ., по имени которой епархия носила название (25.5.1925 Енисейской губ. была ликвидирована), и стал центром Красноярского округа Сибирского края. После 1925 до кон. 1930-х название епархии «Красноярская и Енисейская» (или титул епископа «Красноярский и Енисейский») в официальных документах не встречается (архиерей именуется «Красноярским»; см., например: Журнал Московской Патриархии. 1931. № 4. С. 1; 1933. № 16/17. С. 9; 1934. № 22. С. 4). Владыка Амфилохий (Скворцов) летом 1925 подписывался титулом «Красноярский» (см.: Представление епископа Красноярского Амфилохия Патриаршему Местоблюстителю митрополиту Крутицкому Петру на награждение митрой протоиерея В. А. Фигуровского, ок. 12.7.1925 г. // Красноярская (Енисейская) епархия РПЦ ... С. 337). По всей видимости, именно с даты хиротонии священномученика Амфилохия 8.3.1925 (возможно, чуть позже в 1925, когда ликвидировалась Енисейская губ., но не позднее лета 1925) епархия стала именоваться Красноярской (до 1922 она определенно называлась Енисейской и Красноярской, а с 1922 до 8.3.1925 правящие архиереи не назначались). С 1937 до 1942 правящие архиереи не назначались, с 27.12.1942 правящий архиерей определенно носил титул «Красноярский».

После перевода в нач. янв. 1944 святителя Луки (Войно-Ясенецкого) с Красноярской кафедры на Тамбовскую Красноярская епархия сначала временно управлялась архиепископом Новосибирским и Барнаульским Варфоломеем (Городцовым), затем приходы Красноярской епархии вошли непосредственно в состав Новосибирской епархии и пребывали в ней вплоть до восстановления самостоятельной Красноярской епархии определением Поместного собора 7–8.6.1990. Время такого вхождения приходов Красноярской епархии в состав Новосибирской — не позднее 23.1.1948, даты назначения епископа Иоанникия (Сперанского) «епископом Красноярским, викарием Новосибирской епархии», либо еще раньше: не позднее 5.8.1947 — даты назначения «епископом Красноярским» Софрония (Иванцова) (подробнее об этом назначении, в частности о том, что это тоже было, по всей видимости, назначение викария Новосибирской епархии, при этом Красноярской епархией на правах правящего архиерея продолжал управлять архиепископ Новосибирский и Барнаульский Варфоломей, см. в комментарии на странице Красноярского викариатства). Красноярское викариатство Новосибирской епархии просуществовало до марта 1949, после этой даты в публикациях Журнала Московской Патриархии приходы Красноярского края упоминаются относящимися к Новосибирской епархии (см., например: Из Новосибирской епархии. Архипастырские служения в г. Красноярске). При восстановлении Красноярской епархии в определении Поместного Собора 7–8.6.1990 также было сказано, что «приходы, находящиеся в Красноярском крае», «выделяются» из Новосибирской епархий и из них «образуется Красноярская епархия».